尖锐湿疣诊断主要依据接触传染病史、尖锐湿疣发病部位、临床表现、临床试验及实验室有关检查来确定。对大多数病例，根据尖锐湿疣的发病部位及典型临床特征则不难作出诊断。对少数病例需要进一步临床试验和实验室检查来确诊。
1.病史要注意了解并仔细询问患者是否有接触传染病史，重点要了解其性伙伴有无尖锐湿疣及有无其他性病以及性活动方式，如有否口交、肛交等。HPV感染者性接触或共用毛巾、衣物、盆等物品的病史。
2.尖锐湿疣好发部位是男女性外生殖器以及肛门部位。除这些部位外，一些特殊的部位如口腔、咽喉部等部位的尖锐湿疣病变在特殊人群中应注意。在检查尖锐湿疣发病部位过程中，不要只检查患者所述病变部位，而且要对患者进行较全面的检查，如在检查外阴部位的同时应检查肛门部位，在检查肛门部位的同时也应检查外阴部位，以及对有特殊性活动方式者进行口腔、咽喉等部位的检查。
3.尖锐湿疣临床表现在检查过程中要仔细观察损害分布、形态、大小、颜色、表面情况等。尖锐湿疣特征性损害是典型的菜花型损害，颜色鲜红、淡红或少数呈污灰色，病变组织脆、擦拭后容易出血，即使是非特征性损害其损害表面多呈疣状外观、不光滑或呈颗粒状突起等。
4.尖锐湿疣临床试验目前临床试验多用醋酸试验，醋酸试验阳性对尖锐湿疣诊断有较为重要的意义。1996年美国修订了生殖器疣的诊断标准如下。
①临床描述：感染的特点为在内外生殖器、会阴或肛门周围出现可见的外生(高起)的增生物。
②实验室诊断标准：活检或脱落细胞标本中有HPV感染的组织病理学变化特点；或在损害活检中用抗原或核酸检测显示有病毒。
③确诊病例：临床上符合且经实验室检查证实的病例。
尖锐湿疣的诊断是能够准确治疗尖锐湿疣的第一步，很多人对尖锐湿疣或许有一定的了解，知道尖锐湿疣是一种传染性很强的疾病，但是对于尖锐湿疣的诊断却很陌生，对如何诊断尖锐湿疣知识的匮乏还会造成治疗时间的增加，治疗费用的增加，那么如何诊断尖锐湿疣呢?
如何诊断尖锐湿疣：
首先可以根据症状来判断：男性患者好发于包皮系带、冠状沟、包皮、尿道、阴茎、肛门周围和阴囊。病初为淡红或污红色粟状大小赘生物，性质柔软，顶端稍尖，逐渐长大或增多。可发展成乳头状或囊状，基底稍宽或有带，表面有颗粒。在肛门部常增大，状如菜花，表面湿润或有出血，在颗粒间常积存有脓液，散发恶臭气味，搔抓后可继发感染，可以从症状来判断是否是尖锐湿疣。
其次可以醋酸白试验：细胞学检查和病理活检三种。醋酸白试验是在在起疑病损处涂3%—5%醋酸5—10分钟，万一见部分皮肤粘膜变白，即为醋酸白试验阳性，可作为尖锐湿疣的诊断依据之一，但是醋酸白试验在一定程度上还会出现漏诊的状况，需要进一步的检查。
最后病理活检：镜下见主要有乳头瘤样增生，棘层增厚，棘层上部和颗粒层赤露凹空细胞，这些空泡化细胞较结实细胞大，核浓缩，核环境有渗透晕，病理检查客观上来说是比较准确的。